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2026年5月1日,中國科學(xué)院水生生物研究所聯(lián)合南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、江漢大學(xué)、吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)、西北工業(yè)大學(xué)等,在Science期刊發(fā)表題為Rumen ciliates modulate methane emissions in ruminants 的研究論文。該研究解析了瘤胃纖毛蟲調(diào)控反芻動(dòng)物甲烷排放的分子機(jī)制,首次發(fā)現(xiàn)了一種起源于內(nèi)膜系統(tǒng)、具有單層膜結(jié)構(gòu)的新型產(chǎn)氫細(xì)胞器——Hydrogenobody(氫小體),重塑了關(guān)于瘤胃纖毛蟲在反芻動(dòng)物甲烷排放中作用的理解,為開發(fā)基于纖毛蟲的畜牧業(yè)甲烷減排策略與技術(shù)奠定了基礎(chǔ)。
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全球溫室效應(yīng)主要由二氧化碳和甲烷等溫室氣體排放導(dǎo)致。甲烷是第二大溫室氣體,其熱能留置能力是二氧化碳的23倍。當(dāng)前,全球甲烷排放的增加主要源于人類活動(dòng),如畜牧業(yè)、水稻種植、化石能源生產(chǎn)與利用等,其中牛、羊等反芻動(dòng)物排放的甲烷占全球人為甲烷排放量的30%以上。反芻動(dòng)物排放的甲烷不僅造成環(huán)境污染,也會導(dǎo)致飼料能量的損失。反芻動(dòng)物擁有四個(gè)胃,瘤胃是其中最大的一個(gè)。瘤胃內(nèi)共生著細(xì)菌、古菌、原蟲(主要是纖毛蟲)和真菌等多類原核及真核微生物,這些微生物通過厭氧發(fā)酵降解和消化飼草中的纖維等成分,產(chǎn)生宿主可利用的營養(yǎng)物質(zhì)。與此同時(shí),發(fā)酵過程也會生成大量甲烷,成為反芻動(dòng)物甲烷排放的主要來源。纖毛蟲在瘤胃微生物量中占比最高可達(dá)50%左右,其與產(chǎn)甲烷菌及甲烷排放密切相關(guān)。盡管瘤胃纖毛蟲長期以來被認(rèn)為能夠調(diào)控反芻動(dòng)物的甲烷排放,但其具體機(jī)制尚不清楚。系統(tǒng)解析反芻家畜胃腸道微生物的甲烷代謝機(jī)制,瘤胃纖毛蟲是不可或缺且必須攻克的關(guān)鍵。
在這一背景下,本研究通過多團(tuán)隊(duì)合作,在瘤胃纖毛蟲資源挖掘、新型產(chǎn)氫細(xì)胞器的發(fā)現(xiàn)以及甲烷排放調(diào)控機(jī)制等方面取得了重要進(jìn)展:
1)新資源:針對瘤胃纖毛蟲樣品普遍存在多種污染的難點(diǎn),依托萬種原生生物基因組(P10K)計(jì)劃,開發(fā)了瘤胃纖毛蟲基因組去污染技術(shù),進(jìn)而建立了目前最大的瘤胃纖毛蟲基因組資源庫(450個(gè)),將其分為多毛(纖毛覆蓋整個(gè)細(xì)胞)和少毛(纖毛僅覆蓋細(xì)胞口器區(qū)域)兩大類,涵蓋6科18屬。研究突破了3種瘤胃纖毛蟲的厭氧培養(yǎng)方法,并建立了活體種質(zhì)資源,為本研究的順利開展奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。
2)新發(fā)現(xiàn):在瘤胃纖毛蟲中首次發(fā)現(xiàn)了一種起源于內(nèi)膜系統(tǒng)、具有單層膜的新型產(chǎn)氫細(xì)胞器——Hydrogenobody(氫小體)。該結(jié)構(gòu)與以往在其他真核生物中發(fā)現(xiàn)的、起源于線粒體且具有雙層膜的Hydrogenosome(產(chǎn)氫體)截然不同。氫小體中含有獨(dú)特的氫化酶和氧還原酶,在氫氣生成和清除進(jìn)入瘤胃的氧氣中發(fā)揮關(guān)鍵作用,為瘤胃產(chǎn)甲烷菌提供底物并維持厭氧環(huán)境,可作為干預(yù)反芻動(dòng)物甲烷排放的分子靶標(biāo)。
3)新機(jī)制:基于瘤胃纖毛蟲基因組目錄,對近兩千個(gè)宏組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,揭示了纖毛蟲、產(chǎn)甲烷菌與甲烷排放之間的強(qiáng)相關(guān)性。研究闡明了不同瘤胃纖毛蟲影響反芻動(dòng)物甲烷排放高低的機(jī)制:氫小體分布于纖毛蟲細(xì)胞中纖毛覆蓋的區(qū)域,使得多毛類纖毛蟲的氫小體豐度遠(yuǎn)高于少毛類(相差數(shù)十倍),其對瘤胃產(chǎn)甲烷的貢獻(xiàn)也顯著大于少毛類。該結(jié)論通過培養(yǎng)體系得到了驗(yàn)證。因此,多毛類纖毛蟲可作為干預(yù)反芻動(dòng)物甲烷排放的靶標(biāo)纖毛蟲物種。
整體而言,研究挑戰(zhàn)了既有認(rèn)知,提出了以“氫小體介導(dǎo)的產(chǎn)氫-除氧耦合”為核心的瘤胃纖毛蟲調(diào)控甲烷生成新路徑,闡明了不同纖毛蟲差異化影響反芻動(dòng)物甲烷排放的機(jī)制,明確了干預(yù)甲烷排放的分子靶標(biāo)與關(guān)鍵纖毛蟲類群。研究為深入理解瘤胃甲烷代謝、挖掘減排新靶點(diǎn)奠定了基礎(chǔ),對推動(dòng)畜牧業(yè)實(shí)現(xiàn)“碳減排”目標(biāo)具有重要意義。
謝斐、姜傳奇、李志鵬、馮金梅和閆小婷為論文的共同第一作者,繆煒、熊杰、毛勝勇和邱強(qiáng)為共同通訊作者。研究得到了中國科學(xué)院水生生物研究所分析測試中心、北京大學(xué)冷凍電鏡平臺、中國科學(xué)院超級計(jì)算武漢分中心、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)生物信息高性能計(jì)算平臺以及國家水生生物種質(zhì)資源庫的支持。
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圖1. 瘤胃纖毛蟲影響反芻動(dòng)物甲烷排放高低的機(jī)制
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圖2. 瘤胃纖毛蟲基因組目錄(Vest,多毛類;Ento,少毛類)
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圖3. 瘤胃纖毛蟲新型產(chǎn)氫細(xì)胞器——?dú)湫◇w(HB,hydrogenobody;CM,cell membrane;EEB,ecto-endoplasmic boundary)
原文鏈接:http://doi.org/10.1126/science.adv4244
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