近日,知名行業(yè)媒體BioPharmaTrend發(fā)布2026年AI原生(AI-Native)生物科技企業(yè)名單。
所謂AI原生,即從創(chuàng)立之初就以AI為底層核心,這類Biotech不是在傳統(tǒng)研發(fā)流程上疊加AI工具,而是用AI重構(gòu)整個(gè)藥物研發(fā)全流程。
名單介紹了幾家新成立的公司,它們將AI深度應(yīng)用于RNA 設(shè)計(jì)、生物分子建模、調(diào)控DNA 工程、實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化等多個(gè)領(lǐng)域。
這些項(xiàng)目集中反映出AI制藥的前沿風(fēng)向,有望揭示行業(yè)未來最具價(jià)值的增長(zhǎng)賽道。
智藥局結(jié)合公開信息,對(duì)上述公司進(jìn)行了整理,以供業(yè)內(nèi)參考。
Blank Bio
面向療法開發(fā)與臨床試驗(yàn)的RNA基礎(chǔ)大模型
Blank Bio是一家由YC(Y Combinator)投資的科技生物公司,2025年在加州舊金山成立,由Philip Fradkin、Jonny Hsu與Ian Shi 聯(lián)合創(chuàng)立。
公司致力于打造新一代RNA基礎(chǔ)大模型,為RNA療法、生物標(biāo)志物與診斷技術(shù)提供覆蓋全研發(fā)流程的支持。
模型可對(duì)不同RNA分子變體、突變及其在細(xì)胞中的表達(dá)水平進(jìn)行分析,預(yù)測(cè)其穩(wěn)定性與蛋白表達(dá)量,在計(jì)算機(jī)中高效模擬多項(xiàng)濕實(shí)驗(yàn)。
基于這些預(yù)測(cè),系統(tǒng)能夠優(yōu)化mRNA 序列以提升效果,分析血液樣本中的游離 RNA,在特定RNA變體層面識(shí)別生物標(biāo)志物,并發(fā)現(xiàn)全新的RNA藥物靶點(diǎn),同時(shí)支持RNA靶向療法的設(shè)計(jì)。
公司表示,這類模型還可實(shí)現(xiàn)更精準(zhǔn)的患者分層,助力設(shè)計(jì)更高效的臨床試驗(yàn)。
目前Blank Bio的開源模型已被制藥巨頭如賽諾菲和葛蘭素史克(GSK) 使用,公司還與Arc Institute合作,將其RNA嵌入技術(shù)整合到下一代虛擬細(xì)胞模型中。
Boltz PBC
面向藥物研發(fā)的開源生物分子基礎(chǔ)大模型
Boltz PBC專注于研發(fā)用于藥物發(fā)現(xiàn)的生物分子基礎(chǔ)大模型。公司于 2026 年初正式公開亮相,完成由A16z領(lǐng)投的2800萬(wàn)美元種子輪融資。
Boltz源自麻省理工學(xué)院計(jì)算機(jī)科學(xué)與人工智能實(shí)驗(yàn)室(MIT CSAIL),核心技術(shù)圍繞 Boltz 系列模型展開,由Gabriele Corso、Jeremy Wohlwend、Saro Passaro (下圖從左至右)共同創(chuàng)立。
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該平臺(tái)依托一系列能深度理解蛋白質(zhì)及其他生物分子3D 結(jié)構(gòu)的大型 AI 模型,將其轉(zhuǎn)化為科研人員可直接用于分子設(shè)計(jì)與預(yù)測(cè)的實(shí)用工具。
2024年底發(fā)布的Boltz-1,是首個(gè)性能達(dá)到 AlphaFold3 水平且完全開源的模型,能夠精確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)、配體、核酸等生物分子復(fù)合物的 3D 結(jié)構(gòu)。
后續(xù)發(fā)布的Boltz-2進(jìn)一步超越了結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),引入了親和力預(yù)測(cè)。它能夠以比傳統(tǒng)物理模擬快 1000 倍的速度預(yù)測(cè)藥物分子與靶點(diǎn)結(jié)合的緊密程度,極大地加速了早期藥物篩選。
公司還發(fā)布了BoltzGen,一個(gè)生成式AI 模型,專門用于從零開始設(shè)計(jì)能夠結(jié)合特定生物靶點(diǎn)的蛋白質(zhì)。
這些模型被整合進(jìn)Boltz Lab平臺(tái),并提供了用于小分子和蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)的AI智能體,可自動(dòng)完成結(jié)合分子生成、親和力預(yù)測(cè)排序、合成可行性篩選等全流程工作。
Boltz已與輝瑞達(dá)成合作,基于輝瑞內(nèi)部數(shù)據(jù)對(duì)基礎(chǔ)大模型進(jìn)行專項(xiàng)訓(xùn)練,打造專供輝瑞使用的定制版本,用于結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、小分子親和力評(píng)估與生物藥設(shè)計(jì);而通用版模型則繼續(xù)向全球科研社區(qū)開放使用。
Origin
用于更安全細(xì)胞與基因治療的調(diào)控DNA設(shè)計(jì)
Origin是一家總部位于舊金山的初創(chuàng)公司,2025 年由 CEO Yash Rathod 與 CTO Malhar Bhide 聯(lián)合創(chuàng)立,并入選 Y Combinator 2026 年冬季創(chuàng)業(yè)營(yíng)。
公司致力于通過設(shè)計(jì)調(diào)控DNA“開關(guān)”(啟動(dòng)子與增強(qiáng)子),讓細(xì)胞與基因治療更加安全,精準(zhǔn)控制治療基因在體內(nèi)的表達(dá)位置與強(qiáng)度。
傳統(tǒng)的細(xì)胞和基因療法(如CAR-T)雖然強(qiáng)大,但往往由于無法精確控制基因在何時(shí)、何地表達(dá),容易產(chǎn)生毒性。Origin的目標(biāo)是通過編程讓藥物只在病變細(xì)胞中生效。
2025年10月,Origin 正式發(fā)布AI模型Axis,該模型既能預(yù)測(cè)現(xiàn)有調(diào)控序列的行為,也能從頭設(shè)計(jì)全新序列。
根據(jù)公司披露的數(shù)據(jù),其Axis 模型在預(yù)測(cè)調(diào)控元件活性方面,平均優(yōu)于 Google DeepMind 的 AlphaGenome 模型約6.7%。
公司正在構(gòu)建全球最大的合成調(diào)控序列專有數(shù)據(jù)庫(kù),涵蓋多種細(xì)胞狀態(tài)。主要應(yīng)用于癌癥、中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)疾病等領(lǐng)域的基因療法優(yōu)化。
Manas AI
端到端藥物研發(fā),專注腫瘤與罕見病
Manas AI是一家成立于2025年的全棧式AI原生生物制藥公司,聯(lián)合創(chuàng)始人包括腫瘤學(xué)家、普利策獎(jiǎng)獲得者Siddhartha Mukherjee與領(lǐng)英聯(lián)合創(chuàng)始人Reid Hoffman、前谷歌工程高管Ujjwal Singh。
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圖:Reid Hoffman(左)和Siddhartha Mukherjee(右)
公司公開亮相時(shí)完成2460萬(wàn)美元種子輪融資,由General Catalyst與Reid Hoffman聯(lián)合領(lǐng)投,之后又宣布追加2600萬(wàn)美元種子輪融資。
Manas AI專注開發(fā)腫瘤與罕見病藥物,早期公開信息顯示,其首批項(xiàng)目聚焦乳腺癌、前列腺癌與淋巴瘤。
Manas稱其核心模型為神經(jīng)符號(hào)科學(xué)基礎(chǔ)大模型,將物理定律與深度學(xué)習(xí)相結(jié)合,目標(biāo)是大幅縮短研發(fā)周期、降低腫瘤與罕見病新藥的開發(fā)成本。
公司平臺(tái)覆蓋藥物研發(fā)全流程:從早期靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、分子設(shè)計(jì)、實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證到臨床試驗(yàn),將AI 系統(tǒng)與生物學(xué)家、化學(xué)家、臨床醫(yī)生的專業(yè)判斷結(jié)合,可用于抗體、小分子、RNA 藥物及聯(lián)合療法等多種類型。
2026年初,Manas AI 與Schr?dinger達(dá)成了深度戰(zhàn)略合作。通過整合Schr?dinger的物理模擬平臺(tái),Manas能夠以傳統(tǒng)方法 100 倍的速度進(jìn)行大規(guī)模分子對(duì)接。
Strand AI
用于補(bǔ)齊缺失組學(xué)與臨床數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)大模型
Strand AI成立于2025年,由Yue Dai (CEO) 和 Oded Falik (CTO) 創(chuàng)立,總部位于舊金山,專注于生命科學(xué)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)。
公司致力于打造面向生命科學(xué)的多模態(tài)患者數(shù)據(jù)集,重點(diǎn)應(yīng)用于藥物發(fā)現(xiàn)與臨床開發(fā)場(chǎng)景。
Strand AI構(gòu)建生物學(xué)基礎(chǔ)模型,并從已測(cè)得的生物讀數(shù)中預(yù)測(cè)“缺失”的生物數(shù)據(jù),重構(gòu)臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)中缺失或未檢測(cè)的組學(xué)信息,讓原本數(shù)據(jù)不完整的患者樣本仍可被使用。
對(duì)于樣本量少、數(shù)據(jù)缺失嚴(yán)重的罕見病研究,該平臺(tái)可合成缺失指標(biāo),讓原本無法訓(xùn)練的模型成為可能。
Strand還開放了一款交互式工具,可展示AI基于DNA變異預(yù)測(cè)的跨組織、跨人群 RNA 表達(dá)情況,并支持?jǐn)?shù)據(jù)瀏覽與下載。
Medra AI
面向藥物研發(fā)的全自動(dòng)AI機(jī)器人實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化平臺(tái)
Medra是一家總部位于舊金山的初創(chuàng)公司,致力于為生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)室打造所謂“物理AI科學(xué)家”,由斯坦福大學(xué)機(jī)器人專家、前紐約大學(xué)教授 Michelle Lee 于2021年創(chuàng)立。
Medra于2025年9月正式走出隱身模式,并在同年12月完成5200萬(wàn)美元A輪融資,由 Human Capital 領(lǐng)投,Lux Capital、Menlo Ventures、Fusion Fund 等參投,累計(jì)融資額達(dá)到約 6300 萬(wàn)美元。
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Medra的核心目標(biāo),是打通計(jì)算機(jī)藥物發(fā)現(xiàn)模型與濕實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證之間的閉環(huán),讓 AI 系統(tǒng)能夠在7×24 小時(shí)無人值守的全自動(dòng)實(shí)驗(yàn)室中,自主開展實(shí)驗(yàn)并持續(xù)迭代優(yōu)化。
Medra開發(fā)了一個(gè)通用的AI視覺控制層,可以讓廉價(jià)、靈活的協(xié)作機(jī)器人手臂像人類實(shí)驗(yàn)員一樣“看”并“操作”實(shí)驗(yàn)器材,并在幾小時(shí)內(nèi)完成部署。
Medra平臺(tái)由兩大核心模塊組成:
物理AI(Physical AI):通用型實(shí)驗(yàn)室機(jī)器人集群,可對(duì)接標(biāo)準(zhǔn)儀器、讀取屏幕、操作按鍵、處理實(shí)驗(yàn)耗材,能自動(dòng)化普通實(shí)驗(yàn)室中約 70% 的設(shè)備操作。
科學(xué)AI(Scientific AI):基于大語(yǔ)言模型與視覺模型構(gòu)建的推理層,負(fù)責(zé)提出科學(xué)假設(shè)、設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案、解讀實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
Resonate Bio
基于AI驅(qū)動(dòng)的核磁共振平臺(tái),用于結(jié)構(gòu)導(dǎo)向藥物設(shè)計(jì)
Resonate Bio是一家位于維也納的生物技術(shù)公司,2025 年由 Darryl B. McConnell、Gerald Platzer 與 Robert Konrat 從維也納大學(xué)孵化成立。
傳統(tǒng)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù)(如X 射線晶體學(xué))只能給蛋白質(zhì)拍攝“照片”,即靜態(tài)結(jié)構(gòu)。然而,人體內(nèi)約有一半的致病蛋白是高度柔性且處于動(dòng)態(tài)變化的,這使得它們很難通過靜態(tài)模型來設(shè)計(jì)藥物。
Resonate Bio的開發(fā)了AI-NMR混合技術(shù)。通過結(jié)合核磁共振(NMR)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和先進(jìn)的AI算法,他們能夠生成蛋白質(zhì)與藥物結(jié)合時(shí)的動(dòng)態(tài)“電影”。
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與傳統(tǒng)單一靜態(tài)結(jié)構(gòu)不同,該系統(tǒng)可輸出蛋白質(zhì)配體構(gòu)象集合及其相對(duì)豐度,被認(rèn)為是結(jié)構(gòu)導(dǎo)向藥物設(shè)計(jì)(SBDD)的一次重大升級(jí)。
這類構(gòu)象集合專為動(dòng)態(tài)靶點(diǎn)的結(jié)構(gòu)導(dǎo)向藥物設(shè)計(jì)服務(wù),可攻克傳統(tǒng)晶體學(xué)、冷凍電鏡難以觸及的“不可成藥” 靶點(diǎn)。
在實(shí)際應(yīng)用中,AI模型從 NMR 數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí),以高通量方式推斷大量化合物的潛在三維結(jié)合模式,為藥物化學(xué)家在設(shè)計(jì)與優(yōu)化小分子藥物時(shí)提供更豐富的結(jié)構(gòu)信息。
—The End—
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