巨頭亞馬遜,也深度入局生命科學了。
就在今天(美東4月14日),亞馬遜正式推出Amazon Bio Discovery。
這是一款專為生命科學設計的AI智能體,重點面向早期藥物發現。
它集成了超過40個行業頂級生物醫藥大模型,用于生成和評估潛在的藥物分子,為科研人員提供一站式干濕試驗閉環平臺,將候選藥物從計算篩選到實驗室測試的整個流程縮短至數周。
同一天,亞馬遜與頂級醫療大學約翰斯·霍普金學院共同發布,全球AI抗體設計數據庫。
該數據庫是行業最大、最多樣化的AI抗體數據集,涵蓋50種種子抗體、4種結構格式和42種抗原,多樣性是現有公開庫的20倍。
亞馬遜布局AI Agent+藥物研發,這個時間點非常耐人尋味。
就在昨天,諾和諾德宣布牽手OpenAI,將把AI深度應用于藥物研發、制造及商業運營全流程。
前不久,AI科技巨頭Anthropic斥資近4億美元(約合30億元人民幣)收購 Coefficient Bio,加強在生命科學的布局。
要知道,亞馬遜一直以來在制藥領域的角色是算力提供者,全球前20名制藥公司中有19家已使用其云服務。
亞馬遜,也要來AI制藥搶占新的生態位了。
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醫藥AI Agent,科學家一鍵啟用
此次亞馬遜發布的Amazon Bio Discovery,引發了行業的關注。
它不僅僅是一個簡單的生命科學平臺,更標志著亞馬遜向整個生命科學邁出了一大步。
如今,干濕試驗閉環已經是AI醫藥行業的標配,實驗室再做實驗驗證,結果再反哺 AI,大大加快找藥速度。
但對絕大多數科研團隊來說,這個過程卻并不順暢:
生物 AI 模型更新太快,五花八門,各有各的用法和要求;
做計算的生物學家,既要評估新模型、又要落地使用,還得支持各種項目,設備、資源往往跟不上;
做實驗的科學家懂生物、懂實驗,但不會用計算工具,只能干等別人幫忙;
兩邊合作經常卡殼:不是沒數據,是工具不支持同一個工作流等。
于是,亞馬遜打造了Amazon Bio Discovery,該平臺類似英偉達的BioNeMo平臺,集成了眾多生物化學模型和醫藥研發工具。
它本質上是一個面向生物學家和藥物研發人員的智能Agent平臺,旨在大幅降低AI制藥的門檻。
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5個步驟,搭建AI醫藥工作流
以抗體設計為例,Amazon Bio Discovery通過5大步驟,實現自動化藥物研發。
第一步:挑選AI 模型,搭建專屬計算工作流
目前,平臺自帶40多種生物AI模型,包括Apheris、Boltz、Profluent等合作伙伴的領先開源和商業模型。
這些模型覆蓋抗體研發的各類需求,比如預測抗體結合能力、評估抗體能不能落地開發等。
研究人員可以按照自己的研究目標篩選模型,還能借助平臺的評估標準,把不同模型放在一起橫向對比,直觀看清優劣。
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圖:AI生物學模型可開發性性能與真實抗體數據集的比較
這樣一來,做計算的科研人員不用再耗費精力搭建底層設備、重復寫代碼、單獨搭建數據通道。只需要專注科研本身,做好專業的模型搭配、數據標準設定。
第二步:借助AI ,快速設計模擬實驗
確定好工作流程后,AI智能體會全程引導科學家完成實驗的核心設置。拿抗體研發舉例,它會精準定位關鍵氨基酸位點,挑選適配的抗體結構支架,這些關鍵條件,直接決定抗體和目標抗原的結合效果。
智能體會自動整合多類數據,綜合考量結構接觸范圍、疏水特性等關鍵要素,每一項推薦建議,都會附上科學原理和參考依據。
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圖:識別目標抗原上的熱點殘基
第三步:AI 篩選優質候選分子,深度分析實驗數據
模擬計算實驗結束后,平臺會自動整理結果,提前篩選出一批優質候選分子。
這些候選分子都經過了多維度優化和風險排查,提前規避了會影響抗體穩定性、藥效和量產開發的各類問題,從源頭減少無效研究。
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圖:多維度篩選后,AI推薦候選分子
每一個入選的候選分子,都會標注清楚推薦理由。同時平臺配備專業分析工具,支持分子動力學分析、序列多樣性核查等深度分析。
第四步:一鍵對接合作實驗室,自動打通數據閉環
敲定最終要測試的候選分子后,在平臺內就能直接對接合作的CRO、第三方實驗室等。只需要選定檢測實驗類型,就能實時看到實驗成本、交付周期,告別以往手動對接過程。
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圖:候選分子直接發送給集成的CRO合作伙伴,附帶檢測細節、成本估算和周轉時間
線下實驗全部完成后,實驗數據會自動同步回流到亞馬遜這套系統里。所有實驗數據統一收納管理還能直觀對比 AI 預測結果和真實實驗數據。并且所有過往所有研究數據,都能在統一平臺查看整理。
第五步:實驗數據反哺模型,形成閉環持續優化
這也是「干濕試驗閉環」模式最核心的優勢。真實的線下實驗數據會全部反饋給 AI 模型,用最新的實測數據持續微調、優化模型算法。
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圖:在模型微調前驗證濕實驗室數據質量
經過多輪「AI 預測—實驗驗證—數據反哺—模型升級」的循環,模型的預測準確率會越來越高,篩選出的藥物候選分子可靠性也會穩步提升。
其內置的AI智能體可幫助研究人員自動選擇模型、設定參數并解釋結果,將候選藥物從計算篩選到實驗室測試的整個流程縮短至數周。
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發布行業最大AI抗體數據集
就在同一天,亞馬遜與約翰霍普金斯大學 Gray 實驗室聯合發布,抗體可開發性基準數據庫。
該數據集是目前全球公開領域規模最大、多樣性最高的抗體AI評測標準數據集。
數據集包含50個具有臨床和科學價值的種子抗體,覆蓋IgG、VHH、NearGermline-IgG、scFv四種結構格式,靶向42種不同抗原。
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此外,數據集重點測量表達量、純度、熱穩定性、聚集性、多反應性、疏水性六大關鍵可開發性指標。
上述指標直接決定了一款抗體能否成為可量產、穩定且安全的治療藥物。
與現有公開數據集相比,它的多樣性達到了前者的20倍。更具突破性的是,數據集不僅包含可開發性良好的抗體樣本,還納入了大量經過系統突變得到的、可開發性不佳的變體。
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所有數據均經過濕實驗室實驗驗證,提供了現有公開基準所缺乏的真實實驗依據。
此外,該數據集支持零樣本學習,能夠在不提前讓模型接觸數據的情況下進行評測,有效避免數據泄露,讓評測結果更具可信度和參考價值。
目前,這款基準數據集已正式嵌入亞馬遜生物發現平臺,供全球科研團隊直接使用。
官方表示,數據集還會繼續保持更新,平臺未來還會添加更多模型。
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AI制藥新基建爭奪戰
這次的平臺化升級,是亞馬遜在AI制藥領域的關鍵舉措。
如今,亞馬遜現在不僅限于算力,而是通過生態打通了從AI模型、到實驗驗證、再到數據反饋的全流程。客戶一旦習慣使用,遷移成本極高,從而被深度鎖定,確保了未來的利潤流。
不僅如此,亞馬遜的野心絕不止于藥物發現環節。
據報道,亞馬遜已將聯合BCG和默克推出用于優化臨床試驗點選擇的AI平臺,優化和改進臨床試驗環節。
這些都指向一個不可逆轉的趨勢——AI正在重塑整個新藥研發的底層邏輯。
這一趨勢下,科技巨頭們都在搶占AI制藥新的生態位,從實驗室、數據、平臺全方位地與醫藥巨頭們合作。
例如OpenAI已經合作了諾和諾德、賽諾菲、禮來、Moderna等跨國醫藥企業,與這些合作伙伴共同打造全球頂尖模型,改變藥物研發。
英偉達也從以往的算力提供商,到組建研發團隊,主動推動醫藥行業發展。
去年一整年,英偉達的研究團隊與全球頂尖實驗室一道,發布了多款行業基礎模型,全部都進入BioNeMo平臺中。
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畢竟,全球每年生物醫藥的研發投入是上萬億元。
屆時,越來越多的制藥研發工作流經人工智能,以及越來越多的制藥研發預算流經科技巨頭們。
—The End—
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